Kepala madrasah dalam konteks manajemen melaksanakan beberapa fungsi terkait dengan posisinya sebagai pemimpin (top Leader) di sebuah lembaga pendidikan, dia akan melakukan sebuah perencanaan (planning) apa yang akan organisasi pendidikan lakukan. Kemudian mengorganisasikan (organising) untuk mencapai rencana tersebut. Selanjutnya menetapkan atau menyusun staff (staffing) organisasi pendidikan mereka dengan sumber daya yang diperlukan. Akhirnya kepala madrasah melakukan pengendalian atau pengawasan (controlling) sumber daya, menjaganya agar tetap beroperasional secara optimal.

Dengan demikian, kepemimpinan pendidikan yaitu kepemimpinan kepala madrasah yang merupakan inti dari organisasi pendidikan, sedangkan organisasi pendidikan adalah inti dari manajemen pendidikan. Maka manajemen pendidikan dalam sebuah organisasi pendidikan pada dasarnya dimaksudkan sebagai suatu proses (aktivitas) penentuan dan pencapaian tujuan organisasi pendidikan melalui pelaksanaan empat fungsi dasar: planning, organizing, actuating, dan controlling. Karena itulah, aplikasi manajemen organisasi pendidikan hakikatnya adalah juga amal perbuatan Sumber Daya Manusia (SDM) organisasi pendidikan yang bersangkutan.